東港雜色蛤生長迅速，養殖周期短，適應性強（廣溫、廣鹽、廣分布），離水存活時間長，是一種適合于人工高密度養殖的優良貝類，是中國四大養殖貝類之一。

把雜色蛤從吐沙池內取出后，還要進行清洗。清洗的要求是把殼上的泥沙和污物全部洗凈。把洗凈后的雜色蛤進行蒸或煮。為保證真空雜色蛤的出成率和等級率，根據經驗一般八成熟為好。蒸煮雜色蛤肉的脫殼方法有兩種，一種是用脫殼機進行脫殼，一種是用手工脫殼。用手工脫殼時，將蒸煮出鍋的雜色蛤倒入塑料周轉筐中，直接用清水沖洗冷卻，使蛤肉快速凝固，以提高出成率。控水后倒在不銹鋼工作臺上，手工脫殼取肉。在脫殼過程中應搞好加工車間衛生，工作人員的工作服、工作帽要清潔并穿戴整齊。在脫殼過程中要盡量保持蛤肉完整。

盡管蛤仔有保護殼，但是在篩選和分類過程中如不小心，貝殼亦會破裂。在苗種的預養成期可采用上升流式的育苗系統，直至殼長達到10-15mm。稍大的蛤仔（6-7mm）則裝入4mm網目的袋子，按3000/ m2放置在海床上。養成前期的其他養殖方法包括按10000/ m2密度將4-5mm苗種放在用塑料網覆蓋的木框中，置于水下（在意大利）；或裝入網袋放在處于低大潮周圍地區的支架上（在愛爾蘭）。放養密度隨蛤仔的生長而逐漸減小。在育苗期，須對養成設施進行清洗，對蛤仔進行分級，并清除諸如蟹之類的敵害。盡管在養成初期可采用盤式養殖，但是蛤仔在土壤中生長更好。

在加工和銷售前通常對它們進行濕儲藏，以便清除沙子。可以在出售前將它們放入塑料網袋，或在池中，或掛在濕儲藏筏上，置于低潮間帶地區進行較長時間的儲藏。